После третьей части серии F.E.A.R. планы обоих братьев рухнули в Тартарары. Придя в себя, Оперативник Ф.Е.А.Р. оказывается в весьма интересном и необычном для него месте с заносчивым братом в собственной голове. Их линии вновь пересеклись - в поисках пропавшего третьего ребёнка Альмы братья вновь отправляются к истокам, при этом захватив ещё одного пассажира.