После запечатывания Четвертым Хокаге Девятихвостого, один из трех легендарных санинов Конохи Дзирайя забирает мальчика с собой из деревни, дабы воспитать из него сильного и опытного шиноби. Этот Наруто не знает Конохи и далеко не такой порядочный, как оригинал - воспитание, видите ли... Хи.